在Windows平台下，該步驟是：
以系統管理員身份登錄到系統。
如果MySQL服務器正在運行，停止它。對於作為Windows服務運行的服務器，進入服務管理器：
開始菜單->控制面板->管理工具->服務
然後在列表中找出MySQL服務器，並停止它。
如果服務器不是作為服務而運行的，可能需要使用任務管理器來強制停止它。
創建1個文本文件，並將下述命令置於單一行中：
SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('MyNewPassWord');
用任意名稱保存該文件。在本例中，該文件為C:MySQL-init.txt。
打開控制台窗口，進入DOS命令提示：
開始菜單->運行-> cmd
假定你已將MySQL安裝到C:mysql。如果你將MySQL安裝到了另一位置，請對下述命令進行相應的調整。
在DOS命令提示符下，執行命令：
C:> C:mysqlinmysqld-nt --init-file=C:MySQL-init.txt
在服務器啟動時，執行由“--init-file”選項命名的文件的內容，更改根用戶密碼。當服務器成功啟動後，應刪除C:MySQL-init.txt。
如果你使用MySQL安裝向導安裝了MySQL，或許需要指定“--defaults-file”選項：
C:> C:Program FilesMySQLMySQL Server 5.1inMySQLd-nt.exe
--defaults-file="C:Program FilesMySQLMySQL Server 5.1my.ini"
--init-file=C:MySQL-init.txt
使用服務管理器，可找到恰當的“--defaults-file”設置：
開始菜單->控制面板->管理工具->服務
在列表中找出MySQL服務，右擊，並選擇“屬性”選項。在可執行字段的Path（路徑）中包含“--defaults-file”設置。
停止MySQL服務器，然後在正常模式下重啟它。如果以服務方式運行服務器，應從Windows服務窗口啟動它。如果以手動方式啟動了服務器，能夠像正常情形下一樣使用命令。
應能使用新密碼進行連接。
在Unix環境下，重置根用戶密碼的步驟如下：
以Unix根用戶身份、或以運行MySQLd服務器的相同身份登錄到系統。
找到包含服務器進程ID的.pid文件。該文件的准確位置和名稱取決於你的分發版、主機名和配置。常見位置是/var/lib/mysql/、/var/run/mysqld/和/usr/local/mysql/data/。一般情況下，文件名的擴展名為.pid，並以MySQLd或系統的主機名開始。
在下述命令中使用.pid文件的路徑名，向mysqld進程發出正常的kill（而不是kill -9），可停止MySQL服務器：
shell> kill `cat /MySQL-data-directory/host_name.pid`
注意，cat命令使用符號“`”而不是“’”：這會使cat的輸出代入到kill命令中。
創建文本文件，並將下述命令放在文件內的1行上：
SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('MyNewPassWord');
用任意名稱保存文件。對於本例，文件為~/MySQL-init。
用特殊的“--init-file=~/mysql-init”選項重啟MySQL服務器：
shell> mysqld_safe --init-file=~/MySQL-init &
文件init-file的內容在服務器啟動時執行，更改根用戶密碼。服務器成功啟動後，應刪除~/MySQL-init。
應能使用新密碼進行連接。
作為可選方式，在任何平台上，可使用MySQL客戶端設置新密碼（但該方法不夠安全）：
停止MySQLd，並用“--skip-grant-tables --user=root”選項重啟它（Windows用戶可省略--user=root部分）。
使用下述命令連接到MySQLd服務器：
shell> MySQL -u root
在MySQL客戶端發出下述語句：
mysql> UPDATE MySQL.user SET Password=PASSWord('newpwd')
-> WHERE User='root';
MySQL> FLUSH PRIVILEGES;
用打算使用的實際根用戶密碼替換“newpwd”。
應能使用新密碼進行連接。
