MySQL數據庫有多種存儲引擎：比如：MyISAM、InnoDB、MERGE、MEMORY(HEAP)、BDB(BerkeleyDB)、EXAMPLE、FEDERATED、ARCHIVE、CSV、BLACKHOLE等等，最常見的也就是MyISAM和InnoDB了，下面主要講解下MyISAM和InnoDB兩種mysql數據庫存儲引擎的區別。
MyISAM引擎是一種非事務性的引擎，提供高速存儲和檢索，以及全文搜索能力，適合數據倉庫等查詢頻繁的應用。MyISAM中，一個table實際保存為三個文件，.frm存儲表定義，.MYD存儲數據,.MYI存儲索引。MyISAM在所有MySQL配置裡被支持，它是默認的存儲引擎，除非你配置MySQL默認使用另外一個引擎。
MySQL服務器中的其他非事務性存儲引擎（如MyISAM）遵從不同的數據完整性范例，稱之為“原子操作”。按照事務術語，MyISAM表總能高效地工作在AUTOCOMMIT=1模式下。原子操作通常能提供可比較的完整性以及更好的性能。與經過優化調整的最快的事務性表相比，它的速度快3～5倍。由於MySQL服務器支持兩種范例，因而你能決定是否利用原子操作的速度更好地服務於你的應用程序，或使用事務特性。該選擇可按表進行。
InnoDB則是一種支持事務的引擎。給MySQL提供了具有提交，回滾和崩潰恢復能力的事務安全（ACID兼容）存儲引擎。所以的數據存儲在一個或者多個數據文件中，支持類似於Oracle的鎖機制。一般在OLTP應用中使用較廣泛。如果沒有指定InnoDB配置選項，MySQL將在MySQL數據目錄下創建一個名為ibdata1的自動擴展數據文件，以及兩個名為ib_logfile0和ib_logfile1的日志文件。
InnoDB鎖定在行級並且也在SELECT語句提供一個Oracle風格一致的非鎖定讀。這些特色增加了多用戶部署和性能。沒有在InnoDB中擴大鎖定的需要，因為在InnoDB中行級鎖定適合非常小的空間。InnoDB也支持FOREIGN KEY強制。在SQL查詢中，你可以自由地將InnoDB類型的表與其它MySQL的表的類型混合起來，甚至在同一個查詢中也可以混合。
InnoDB是為處理巨大數據量時的最大性能設計。它的CPU效率可能是任何其它基於磁盤的關系數據庫引擎所不能匹敵的。InnoDB存儲引擎被完全與MySQL服務器整合，InnoDB存儲引擎為在主內存中緩存數據和索引而維持它自己的緩沖池。
InnoDB存儲它的表＆索引在一個表空間中，表空間可以包含數個文件。InnoDB表可以是任何尺寸，即使在文件尺寸被限制為2GB的操作系統上。InnoDB也默認被包括在所有MySQL 5.1二進制分發版裡。
